A történet a háborút élő,zavaros idejű középkori Japánban játszódik,itt még a ravasz szellemek együtt éltek az emberekkel.Sokféle lény bukkan fel:pl.szellem(démon)félszellem,boszorkány...
A középpontban a Shikon no Tama, vagyis a Négy Lélek Szent ékköve áll, kinek a birtokában van az ékkő,az emberfeletti képességekhez jut, ezért a legtöbb szellem és hataloméhes ember is minél előbb megakarja magának kaparintani,lehetőleg minél több szilánkot...
Így volt ezzel Inuyasha is, aki félig szellem(anyja halandó ember,apja nagyerejű kutyadémon). Végül az ékkő őrzője, Kikyou (a papnő,Inuyasha volt szerelme) egy fához szegezte szent nyílvesszőjével, aminek következtében Inuyasha 50 évig tartó álomba merült.( Az átkot csak Kikyou tudja felodani)Kikyou azon a napon halálos sebet kapott és úgy szerette volna hogy, az ékkövet holttestével együtt égessék el, hogy ne juthasson a gonosz szellemek kezébe.

50 évvel később egy lány tűnik fel a középkori Japánban, a neve Kagome. Ő valójában a modern Tokió városából származik és egy baleset folytán került vissza a Csontok Kútján át az 500 évvel ezelőtti távolkeleti országba. Hamarosan kiderül, hogy Kagome Kikyou reinkarnációja, ezt nem csupán hasonló kinézetük támasztja alá, hanem az is, hogy testében volt a Négy Lélek ékköve.(Amikor megérkezik,egy szellem támadja meg,nem tud menekülni ezért kihúzza Inuyashából a szent nyílvesszőt.Inuyasha kiszabadul,és megöli a szörnyet.)Inuyasha ekkor még nem törődik senkivel,ezért magának akarja az ékkövet.S elszánja magát,hogy Kagomét megöli.Ekkor megérkezik Kaede(Kikyou testvére,papnő)Aki rávarázsolja az Inuyashának szánt nyakláncot.Ez egy különleges nyaklánc,mert még Kikyou készítette Inuyashának,hogy meg tudja akadájozni,hogy Inuyasha ellopja a Shikon no tamat.Kagome a fekszik szóval megállítja az elszánt félszellemet.(ez azért lehetséges mert Kagome Kikyou reinkarnációja)
A kalandok itt kezdődnek, hiszen az ékkő ismét megjelent, a hataloméhes lények közt pedig szélsebességgel terjed a hír. Egy szellemmadárral való harc során Kagome széttöri az ékkövet, ami sokszáz darabra törik szét.Ezután szövetséget köt Inuyasha és Kagome,hogy együtt keressék a Shikon no tama szilánkjait..(Kagome azért mert bűntudata van az összetörése miatt,és ő érzékeli az ékkő darabjait).(Inuyasha pedig azért mert teljes vérű szellem akar lenni.Később megváltozik Kagome hatására,és szerelmes lesz belé.Valamint ő elég erős,hogy megvédje Kagomét.)
Ahogy haladunk előre a váratlan fordulatokban gazdag, eseménydús cselekményben, rengeteg rég fel nem fedett titokra derül fény, és a sokszínű, egyedi karakterek csak még változatosabbá teszik ezt.
Hamarosan Naraku is feltűnik, egy ravasz félszellem, akiről később kiderül, milyen nagy szerepe volt Kikyou halálában és Kikyou Inuyashával való összeugrasztásában.. Nemsokára már ő lesz az ékkődarabok keresése közben bővülő kis csapat legnagyobb ellensége.A csapathoz csatlakozik:Shippou a rókaszellem,Miroku a szerzetes,Sango a szellemírtó és hűséges démonmacskája:Kirara....) Megindul az ékkőszilánk-vadászat és a harc Naraku ellen.A történetben jelenvan a horror,romantika,humor,akció is egyaránt.